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北大科研團(tuán)隊(duì)開發(fā)新型質(zhì)譜流式平臺(tái) 在單細(xì)胞分析領(lǐng)域取得突破
導(dǎo)讀:北大科研團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種深度有機(jī)質(zhì)譜流式分析平臺(tái),該平臺(tái)能夠在線高效地進(jìn)行細(xì)胞裂解和高分辨質(zhì)譜分析,單個(gè)細(xì)胞的分析時(shí)間較現(xiàn)有技術(shù)延長(zhǎng)了40倍。
單細(xì)胞分析涉及對(duì)單個(gè)細(xì)胞的基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀基因組和蛋白質(zhì)組等多維數(shù)據(jù)的深入研究,能夠揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性,為理解生命過程、疾病發(fā)生機(jī)制以及精準(zhǔn)醫(yī)療的發(fā)展提供重要的視角和工具。
近五年來,北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院分析化學(xué)研究所白玉教授課題組在單細(xì)胞分析技術(shù)方面取得了一系列進(jìn)展,包括基于質(zhì)譜標(biāo)簽的信號(hào)放大策略和多維有機(jī)質(zhì)譜流式分析平臺(tái)的開發(fā),這些技術(shù)為腫瘤耐藥性機(jī)制研究提供了新思路。
最近,該課題組在單細(xì)胞代謝組學(xué)分析領(lǐng)域取得了新的突破。他們開發(fā)了一種深度有機(jī)質(zhì)譜流式分析平臺(tái),該平臺(tái)能夠在線高效地進(jìn)行細(xì)胞裂解和高分辨質(zhì)譜分析,單個(gè)細(xì)胞的分析時(shí)間較現(xiàn)有技術(shù)延長(zhǎng)了40倍。這一技術(shù)使得研究人員能夠獲得豐富的代謝物鑒定譜圖,單細(xì)胞代謝物鑒定數(shù)目可達(dá)600種,實(shí)現(xiàn)了普適性的單細(xì)胞異構(gòu)體定性定量分析。
該平臺(tái)由在線高效單細(xì)胞裂解裝置和非接觸電噴霧高分辨質(zhì)譜組成,解決了現(xiàn)有單細(xì)胞代謝組學(xué)方法存在鑒定深度有限、在線分析時(shí)間短、無法獲得二級(jí)質(zhì)譜信息以及不具備同分異構(gòu)體區(qū)分能力等難題,顯著提高了單細(xì)胞分析的效率和準(zhǔn)確性。
通過應(yīng)用這一新技術(shù),研究團(tuán)隊(duì)揭示了MCF-7乳腺癌細(xì)胞存在的精細(xì)亞型,并在《自然-通訊》期刊上發(fā)表。研究團(tuán)隊(duì)還通過不同類型腫瘤細(xì)胞的代謝物信息驗(yàn)證了該流式平臺(tái)的普適性和異構(gòu)體代謝物區(qū)分能力。他們發(fā)現(xiàn),利用3-羥基丁酸/4-羥基丁酸的異構(gòu)體相對(duì)含量信息,可以成功實(shí)現(xiàn)MCF-7細(xì)胞的3種亞型精細(xì)區(qū)分。進(jìn)一步的研究表明,3-羥基丁酸的豐度差異是導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞分型的主要原因,并且與下游多種抗氧化應(yīng)激靶蛋白的表達(dá)量呈正相關(guān)。這一發(fā)現(xiàn)為深入理解腫瘤異質(zhì)性以及乳腺癌的精準(zhǔn)治療提供了新的思路。
北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院在單細(xì)胞組學(xué)研究中的這些進(jìn)展,對(duì)于揭示細(xì)胞表型異質(zhì)性和闡明生物過程的分子機(jī)制具有重要意義,不僅推動(dòng)了生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的深入,也為疾病的診斷和治療提供了新的視角和方法。
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