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“生物多樣性湯”二代來襲 占領(lǐng)生物多樣性監(jiān)測高地

2021-09-16 10:03:37來源:化工儀器網(wǎng) 閱讀量:108 評論

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導(dǎo)讀:近日,中國科學(xué)院昆明動物研究所俞維理研究員及其團隊改進了快速監(jiān)測生物多樣性的高質(zhì)量條形碼技術(shù),該項結(jié)果以《生物多樣性湯II:更低錯誤率的高通量條形碼流程》為名發(fā)表在國際期刊《生態(tài)學(xué)與進化方法》。

  我國是生物多樣性豐富大國之一。據(jù)國家林業(yè)和草原局統(tǒng)計,我國目前各類保護地總數(shù)達1.18萬個,占陸域國土面積的18%、領(lǐng)海的4.1%。自然分布的野生動物中,脊椎動物約7300余種,其中獸類564種、兩棲類416種、鳥類1445種、爬行類463種,其余為魚類;已定名昆蟲約13萬種;高等植物3萬多種,其中特有植物種類約1.7萬余種。面對豐富物種,實時生物監(jiān)測非常有必要。生物多樣性監(jiān)測是在時間尺度上對生物多樣性的反復(fù)編目,從而確定其變化。它不僅了解生物多樣性情況和生態(tài)分區(qū)范圍,還在保護生物多樣性、評價環(huán)境影響等問題上提供有效數(shù)據(jù)。
 
  近日,中國科學(xué)院昆明動物研究所俞維理研究員及其團隊改進了快速監(jiān)測生物多樣性的高質(zhì)量條形碼技術(shù),該項結(jié)果以《生物多樣性湯II:更低錯誤率的高通量條形碼流程》為名發(fā)表在國際期刊《生態(tài)學(xué)與進化方法》。
 
  其實早在2012年,俞維理研究員及其團隊對區(qū)域內(nèi)昆蟲給樣本的混合DNA測序,實現(xiàn)了對該區(qū)域的生物多樣性編目和監(jiān)測,并將“生物多樣性湯”這一高通量條形碼技術(shù)流程的研究論文發(fā)表在國家期刊《生態(tài)學(xué)與進化方法》。如今通過優(yōu)化多個環(huán)節(jié),生物多樣性監(jiān)測技術(shù)又上一個臺階,“生物多樣性湯”二代來臨。
 
  高通量測序技術(shù)監(jiān)測  獲取大量生物數(shù)據(jù)
 
  “生物多樣性湯”是一種高通量測序技術(shù)的新穎的生物多樣性監(jiān)測手段,可以同時分析大量的混合性生物樣本,獲取地面生物多樣性數(shù)據(jù)。
 
  每種生物都含有DNA,任意的DNA碎片都可以被用于生物物種鑒定,進而實現(xiàn)生物監(jiān)測。“生物多樣性湯”即利用分子手段和測序技術(shù)分析混合生物的DNA樣本,還原物種信息及多樣性特征,包括α多樣性指數(shù)、β多樣性指數(shù)等。
 
  “生物多樣性湯”助力下,研究人員探究云南自然保護區(qū)內(nèi)不同海拔段內(nèi)蛾類的生物多樣性,其結(jié)果可顯示出蛾類的群落組成隨海拔和采樣層次的變化趨勢。不僅如此,“生物多樣性湯”還能分析真菌多樣性對朽木分解的影響:真菌種類越多,朽木的二氧化碳釋放速率越低,朽木腐朽得更慢。
 
  降低高昂數(shù)據(jù)成本  推進多學(xué)科共發(fā)展
 
  目前來說,生物多樣性監(jiān)測包括群落內(nèi)多樣性、群落間多樣性指數(shù)、異地同類生境指數(shù)監(jiān)測。監(jiān)測手段多以人工、儀器、基因技術(shù)監(jiān)測。例如利用紅外觸發(fā)相機,清晰監(jiān)測獸類和地面活動鳥類,錄音機自動采集鳥類的叫聲,通過聲景分析,鑒定生物種類、評估多樣性。又如,分子-組學(xué)技術(shù)不在生物多樣性監(jiān)測中的應(yīng)用廣泛。宏基因組學(xué)方法是土壤微生物鑒定和監(jiān)測的常用方法。土壤動物形態(tài)難以鑒定、耗時較長,將常規(guī)形態(tài)鑒定與分子技術(shù)相結(jié)合會對土壤動物多樣性,起到一定推動作用。
 
  這些傳統(tǒng)監(jiān)測手段耗費大量人工、儀器等多個項目成本。況且,由于其采樣和分類規(guī)模浩大,研究被限制在針對性較強、較小的區(qū)域且難以復(fù)制。因此,保護學(xué)者和環(huán)境管理者們往往只能利用有限的數(shù)據(jù)來進行決策。
 
  與傳統(tǒng)監(jiān)測性比,“生物多樣性湯”技術(shù)憑借其快速、高效、監(jiān)測范圍廣的特點,通過高通量技術(shù),實現(xiàn)了大尺度上復(fù)制和檢驗,監(jiān)測成本大幅減少,可以同時分析大量混合樣本,獲得準(zhǔn)確的生物多樣性數(shù)據(jù),高速、高效提供第三方檢驗數(shù)據(jù),加強監(jiān)測環(huán)境變化指數(shù)和瀕危物種的狀況。
 
  “生物多樣性湯”推動生物監(jiān)測逐漸從形態(tài)學(xué)、細胞學(xué)、生理生化發(fā)展到分子,深刻揭示遺傳物質(zhì)的遺傳、變異情況。該種技術(shù)逐漸被多國自然保護管理部門納入其日常監(jiān)測工作中,改進實驗設(shè)計和生物信息學(xué)分析流程,降低錯誤率、提高運算速率。此外,“生物多樣性湯”不僅讓生物多樣性本身的變化受到關(guān)注,而且將人們的視線延伸到影響生物多樣性的因素如氣候變化、土地利用、環(huán)境污染等,并為相關(guān)學(xué)科如農(nóng)學(xué)、林學(xué)、漁業(yè)學(xué)、土壤學(xué)等提供大量的資料。
 
  構(gòu)建多維監(jiān)測體系  解決兩大難題
 
  目前,生物多樣性調(diào)查、評估與監(jiān)測是獲得生物多樣性數(shù)據(jù)的主要手段,也是開展生物多樣性保護的前提。但目前大量獲取物種信息仍是一個難題。
 
  技術(shù)讓生物多樣性監(jiān)測邁向新紀(jì)元。生物監(jiān)測通過天空地一體化,建立三維監(jiān)測系統(tǒng),多方位監(jiān)測生物多樣性,高效地獲取地面精細的生物多樣性信息。該系統(tǒng)恰好解決了如何快速獲取地面精細的生物多樣性信息,如何將高通量的生物多樣性信號與遙感信號銜接兩個問題。
 
  該三維監(jiān)測系統(tǒng)包括遙感技術(shù)、地理信息系統(tǒng)和全球定位系統(tǒng),以及無人機近地面遙感技術(shù)等。大尺度上以衛(wèi)星遙感為主,小尺度上以近地面遙感為主,包括利用高光譜、多光譜儀、激光雷達采集數(shù)據(jù)。近地面遙感技術(shù)快速推廣得益于無人機廣泛使用。
 
  衛(wèi)星遙感、地面人工觀測和調(diào)查結(jié)合,主要用于整改生態(tài)系統(tǒng),而近地面遙感與人工觀測結(jié)合,用于動植物個體。多維遙感數(shù)據(jù)和高精地面數(shù)據(jù)相連接,構(gòu)建用于監(jiān)測生物多樣性的體系框架。
 
  該體系提供研究區(qū)域長時間跨度、多空間尺度的生物多樣性數(shù)據(jù)。目前,研究團隊將衛(wèi)星、近地面遙感與“生物多樣性湯”技術(shù)相結(jié)合,構(gòu)建“天空地一體化”探索和應(yīng)用研究。
 
  未來,依托“生物多樣性湯”以及三維體系,將推動我國生物多樣性監(jiān)測進程,助力我國盡早占領(lǐng)生物多樣性監(jiān)測的前沿高地。
 
  原標(biāo)題:“生物多樣性湯”二代來襲 占領(lǐng)生物多樣性監(jiān)測高地
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