紫外交聯(lián)儀的實驗原理和步驟分享

　　原理：和非取代的DNA相比較，含有如溴脫氧尿苷胸苷鹵代物的DNA對于紫外線誘導的交聯(lián)有著更高的敏感性。

　　步驟：

　　1、混合10μL含有高親和性蛋白結合位點的目的序列的單鏈M13載體和等摩爾的17 bp M13通用引物，使用1×限制性內切核酸酶緩沖液調節(jié)終體積到100μL。在90攝氏度下加熱5分鐘。在室溫下冷卻、

　　2、在雜交混合物中加入Klenow 酶 5μL、水7μL、10×限制性內切核酸酶緩沖液7.5μL、0.1 mol/L 二硫蘇糖醇1.75μL、50× dNTP/BrdU 溶液 3.5μL、[α32P] dCTP50μ等反應物，在16攝氏度下溫浴90分鐘。

　　3、在68攝氏度下加熱10分鐘，將Klenow 酶滅活。

　　4、使用40U限制性內切核酸酶在合適條件下消化，使得20600 bp的DNA片段產生。

　　5、將乙酸銨添加到0.3 mol/L，DNA使用2倍體積的100%乙醇進行沉淀，在TE緩沖液中重懸。

　　6、電泳在含有0.5μg/mL溴化乙錠的瓊脂糖凝膠上進行。所要的DNA片段使用DEAE膜進行分離。

　　7、BrdU取代的DNA片段的特異活性使用閃爍計數(shù)器進行檢測，DNA的濃度的估計采用溴化乙錠點跡定量法。能夠采用遷移率變動DNA結合分析法來檢測探針的完整性和功能。

　　8、將下列結合反應建立于1.5 mL圓底小瓶中：將10-20μg DNA 載體、經緩沖的含有結合蛋白的提取液以及105cpm均衡標記的探針混合，調節(jié)總體積到50μL。瓶口使用塑料薄膜封住，固定再采用Parafilm膜加封。

　　9、在試管架上放上小瓶，于正上方5厘米處使用倒置的紫外透射燈照射1個小時。

　　10、將1U微球菌核酸酶、DNA 酶 I 4μg、0.5 mol/L CaCl2 1μL等反應物加入到各結合反應管中，在37攝氏度下消化半個小時。

　　11、在反應混合物中加入等體積的2×SDS樣品緩沖液，在100攝氏度中煮沸5分鐘。

　　12、樣品的電泳在適當濃度的不連續(xù)SDS-聚丙烯酰胺凝膠上進行。

　　13、完成電泳之后，將凝膠前沿的染料切去。

　　14、干膠，使用增感屏放射自顯影13日，來對交聯(lián)的蛋白質進行觀測。